Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CENPEQ02224 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CENPEQ02224 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms