Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TMPOP42166 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TMPOP42166 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TMPOP42166 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMPOP42166 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMPOP42166 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms