Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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PTPRDP23468 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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PTPRDP23468 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRDP23468 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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