Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
J3KRW8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3KRW8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3KRW8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3KRW8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
J3KRW8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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