Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms