Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN8AQ9UQD0 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCN8AQ9UQD0 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms