Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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