Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDKN3Q16667 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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