Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SGCAQ16586 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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