Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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