Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RPE65Q16518 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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