Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNGA3Q16281 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms