Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SNCBQ16143 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNCBQ16143 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms