Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SIX1Q15475 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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