Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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SEC23AQ15436 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEC23AQ15436 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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