Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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