Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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RFTN1Q14699 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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RFTN1Q14699 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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RFTN1Q14699 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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RFTN1Q14699 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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RFTN1Q14699 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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RFTN1Q14699 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RFTN1Q14699 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RFTN1Q14699 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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