Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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UBE4AQ14139 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBE4AQ14139 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
UBE4AQ14139 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
UBE4AQ14139 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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