Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PKP1Q13835 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PKP1Q13835 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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