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| RUNX3 | Q13761 | AC022445.1-201 | ENST00000457499 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU13.6-201 | ENST00000458785 | 104 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS29P11-201 | ENST00000496507 | 171 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114801.2-201 | ENST00000503825 | 781 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022447.4-201 | ENST00000504053 | 364 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02118-202 | ENST00000510583 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108729.3-201 | ENST00000513484 | 108 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACA59.1-201 | ENST00000515966 | 143 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SI-201 | ENST00000264382 | 6011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P9-201 | ENST00000503854 | 1755 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161668.1-201 | ENST00000320322 | 358 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-457P-201 | ENST00000363999 | 107 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.813-201 | ENST00000364639 | 102 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC021146.2-201 | ENST00000504736 | 556 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097473.1-201 | ENST00000508142 | 408 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEMA6A-AS1-204 | ENST00000510682 | 521 nt | TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGHVII-53-1-201 | ENST00000519538 | 255 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008083.3-202 | ENST00000552063 | 277 nt | TSL 3 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC010928.2-201 | ENST00000588017 | 287 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012640.5-201 | ENST00000623897 | 319 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591030.1-201 | ENST00000626131 | 627 nt | TSL 3 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD98-201 | ENST00000636377 | 67 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP13A3-201 | ENST00000256031 | 7322 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP57L1-223 | ENST00000523787 | 2522 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX15-203 | ENST00000638951 | 11341 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLMN-201 | ENST00000370360 | 1995 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092268.1-201 | ENST00000342691 | 405 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.4-201 | ENST00000362333 | 112 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU2_19.1-201 | ENST00000362361 | 80 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-15P-201 | ENST00000362613 | 141 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1286P-201 | ENST00000383871 | 107 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-968P-201 | ENST00000384076 | 107 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA75.6-201 | ENST00000391318 | 127 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP4-201 | ENST00000401524 | 249 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.40-201 | ENST00000408706 | 208 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590135.1-201 | ENST00000422215 | 156 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4EP2-201 | ENST00000422816 | 654 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019205.3-201 | ENST00000424573 | 156 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005154.1-208 | ENST00000440438 | 353 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPM6BP3-201 | ENST00000442797 | 145 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016700.2-201 | ENST00000446011 | 156 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.653-201 | ENST00000459091 | 95 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR2053-201 | ENST00000459295 | 91 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015911.1-201 | ENST00000495111 | 156 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016632.1-201 | ENST00000503994 | 196 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02425-201 | ENST00000536217 | 376 nt | TSL 3 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007375.1-201 | ENST00000554513 | 578 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3136-201 | ENST00000583498 | 78 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LUZP6-201 | ENST00000589735 | 177 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z98751.3-201 | ENST00000604447 | 521 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL034555.1-201 | ENST00000604816 | 211 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138963.2-201 | ENST00000605137 | 226 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMAD5-AS1_4.1-201 | ENST00000615561 | 167 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5739-201 | ENST00000619803 | 80 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF404-202 | ENST00000587539 | 1851 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYSLTR1-203 | ENST00000614798 | 2681 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-874P-201 | ENST00000362390 | 105 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.164-201 | ENST00000363709 | 102 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-694P-201 | ENST00000364071 | 147 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.238-201 | ENST00000364441 | 102 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-142P-201 | ENST00000384019 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1274P-201 | ENST00000384557 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR559-201 | ENST00000385188 | 96 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P38-201 | ENST00000423806 | 265 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589935.1-209 | ENST00000432050 | 418 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591501.1-201 | ENST00000439992 | 495 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161788.1-201 | ENST00000441805 | 169 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354949.1-201 | ENST00000446438 | 170 nt | TSL 2 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL30P10-201 | ENST00000488148 | 337 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HYDIN2-201 | ENST00000493714 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093303.1-201 | ENST00000514549 | 295 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1153P-201 | ENST00000516760 | 105 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CBX3P7-201 | ENST00000532876 | 502 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016256.1-201 | ENST00000547971 | 354 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007347.1-201 | ENST00000563879 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PISRT1.1-201 | ENST00000616930 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC126177.8-201 | ENST00000618339 | 1015 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160287.1-202 | ENST00000638113 | 454 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF7-202 | ENST00000560270 | 1688 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |