Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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