Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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