Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms