Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGB3BPQ13352 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
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