Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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SKP2Q13309 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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SKP2Q13309 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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SKP2Q13309 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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SKP2Q13309 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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