Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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