Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CBX3Q13185 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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