Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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