Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TROQ12816 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TROQ12816 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms