Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHRNEQ04844 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms