Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERFP50548 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERFP50548 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERFP50548 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERFP50548 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms