Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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ERVV-1B6SEH8 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERVV-1B6SEH8 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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