Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms