Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRPF3Q9ULD4 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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