Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COPS7AQ9UBW8 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms