Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXC10Q9NYD6 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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