Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SAMD8Q96LT4 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms