Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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