Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KNOP1Q1ED39 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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