Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCDC142Q17RM4 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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