Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms