Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
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