Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNA6Q15825 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNA6Q15825 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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