Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPS6KA1Q15418 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPS6KA1Q15418 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms