Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PCLAFQ15004 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PCLAFQ15004 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms