Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN5AQ14524 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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