Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARB2Q14108 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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