Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PDE6HQ13956 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms