Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms