Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms