Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MSLNQ13421 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MSLNQ13421 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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